自新型冠状病毒肺炎疫情发生以来，基础医学院高度重视疫情防控工作，采取多种方式及措施，动员该院教职工积极应对疫情，做好自我防护等工作。
疫情期间，该院强化责任制度，学院主要负责人每天到岗，全面部署疫情防控及学院发展各项工作，并根据工作需要安排行政工作人员在院值班，做到科学分散办公，为教职工和学生做好各项服务工作。学院严格执行“每日一报”制度，按时上报各项数据，并统计返回合肥的教职工总人数、每日在校人员数（包括居住在校家属区教师）；统计尚未返回合肥教职工所在地，查明教职工中有无从武汉及周边地区返回者，有无密切接触过疑似病例者、有无身体异常及需要观察者，以加强教职工去向追踪。此外，该院积极响应上级要求，从教职工个人健康安全为出发点，动员大家在家隔离、办公，进行网络授课和教学，以及开展各项教学、科研以及学科建设工作。
据悉，该院还根据学校有关职能部门的安排，加强该院出国人员的疫情教育宣传和管理工作，并向公派出国的9位教师及时传达了学校疫情防控工作精神。（基础医学院）